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NadPrep® 甲基化文库构建试剂盒 v2

NadPrep® 甲基化文库构建试剂盒 v2

货号：
#1002511
#1002512
NadPrep® 甲基化文库构建试剂盒是针对 Illumina® 及 MGI 双测序平台开发的双链 DNA 甲基化测序文库构建试剂盒，适用于 1-500 ng DNA 的甲基化文库构建，支持全基因组甲基化测序，同时兼容液相杂交靶向捕获测序，可实现靶向甲基化测序文库富集。该试剂盒适用于多种类型 DNA 样本，包括 gDNA、cfDNA 和 FFPE DNA，同时兼容市面主流的转化方案。在 v1 版本的基础上，v2 缩短了实验耗时，支持更低的样本起始投入量，同时大幅提升了文库产出和有效数据利用率，为用户提供更高效、灵活且可靠的甲基化测序解决方案。
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产品特色

  • 支持 1-500 ng 多类型样本起始投入，大幅提升样本利用率；
  • 兼容多种甲基化转化方式及测序平台，灵活适配多样化应用场景；
  • 搭配亚硫酸氢盐转化，最快可在 4.5 hr 内完成 WGBS 文库制备；
  • 显著提高有效测序深度，改善数据利用率。

建库流程

网页版建库流程


产品表现

高效的文库产出

fig 1

图 1. NadPrep® 甲基化文库构建试剂盒 v2 在不同场景下均能实现稳定高效建库。A. 不同投入量 gDNA 样本分别利用 NadPrep® Methyl Library Preparation Module v1/v2 经 BS 转化建库；B. 不同投入量 gDNA 经 EM 转化建库； C. gDNA & FFPE DNA & cfDNA 经 BS 转化建库；D.不同甲基化水平的模拟样本经 BS 转化建库。
注：D 图中模拟样本为人甲基化阴性对照 0 % Methylated DNA (Zymo, D5014-1) 和阳性对照 100 % Methylated DNA (Zymo, D5014-2) 经不同比例混合以模拟不同甲基化水平 (0%，10%，50% 和 100%)，起始投入量 50 ng。BS：亚硫酸氢盐转化；EM：酶学转化。

稳定的转化效率

fig 2

图 2. 经不同转化方式对不同起始量下多类型样本的转化效率。不同类型样本利用 NadPrep® Methyl Library Preparation Module v2 搭配 NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module (with 10 nt Index) 完成文库构建。A. 不同起始投入量下 gDNA 经不同方式转化的转化效率；B. 多类型样本经 BS 转化的转化效率。测序模式为 Illumina® Novaseq 6000，PE150。

更高的数据利用率

fig 3

图 3. NadPrep® 甲基化文库构建试剂盒 v1 及 v2 的捕获表现。A. 比对率 & 中靶率；B. 靶区域覆盖度；C. 去重后平均测序深度；D. GC 偏好性。不同起始量 gDNA 样本利用 NadPrep® Methyl Library Preparation Module v1 & v2 搭配 NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module (with 10 nt Index) 经 BS 转化后进行预文库构建，以 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 和甲基化 Demo Panel (60 Kb) 完成杂交捕获。选取 0.3 Gb 用于数据分析。

精准定量甲基化水平

fig 3

图 4. NadPrep® 甲基化文库构建试剂盒 v2 精准定量甲基化水平。A. 不同甲基化水平的实际检测结果；B. 靶区域 CpG 甲基化水平。50 ng 不同甲基化水平的模拟样本利用 NadPrep® Methyl Library Preparation Module v2 搭配 NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module (with 10 nt Index) 经 BS 转化后进行构建预文库，以 μCaler® Hybrid Capture Reagents v2 和 μCaler® Methyl Demo Panel (5 Kb) 完成杂交捕获。

灵活兼容超灵敏 μCaler® 杂交捕获系统

fig 3

图 5. NadPrep® 甲基化文库构建试剂盒 v2 对低起始量 gDNA 样本的捕获表现。A. 文库产量；B. 比对率 & 中靶率；C. 靶区域覆盖度；D. 去重后平均测序深度。利用 NadPrep® Methyl Library Preparation Module v2 搭配 NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module (with 10 nt Index) 经 EM 转化后进行预文库构建，以 μCaler® Hybrid Capture Reagents v2 和 μCaler® EMS Panel (20 Kb) 完成杂交捕获。

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

甲基化建库模块

包装编号 管盖颜色 组分名称 包装体积
1002511 (24 rxn) 		包装体积
1002512 (96 rxn)
Box1

EndRepair & A-Tailing Buffer Pro 180 µL 690 µL

End Repair & A-Tailing Enzyme Pro 120 µL 460 µL

Ligation Buffer 750 µL 2×1,500 µL

DNA Ligase 65 µL 250 µL

2X HiFi-Methyl PCR Master Pro Mix 720 µL 2×1,600 µL

/

Nuclease Free Water 2.5 mL 8 mL

TE Solution 1 mL 4 mL
Box2

/

NadPrep SP Beads 4 mL 15 mL

甲基化单标签接头模块 (for MGI)

管盖颜色 组分名称 包装体积
1003631 (24 rxn) 		包装体积
1003632 (96 rxn) 		包装体积
1003633 (96 rxn)

NadPrep M-Index (SI) Primer Mix  # 12×15 µL 24×25 µL 24×25 µL

NadPrep Methyl M-Adapter 60 µL 230 µL 230 µL

甲基化双端唯一接头模块 (for MGI)

管盖颜色 组分名称 包装体积
1003740 (24 rxn) 		包装体积
1003741 (96 rxn) 		包装体积
1003742 (96 rxn) 		包装体积
1003743（96 rxn） 		包装体积
1003744（96 rxn）

NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix  # 12×15 µL 24×25 µL 24×25 µL 24×25 µL 24×25 µL

NadPrep Methyl M-Adapter 60 µL 230 µL 230 µL 230 µL 230 µL

甲基化截短型双端唯一标签接头模块 (for Illumina®)

管盖颜色 组分名称 包装体积
1003371A (24 rxn) 		包装体积
1003381A (96 rxn) 		包装体积
1003382A (96 rxn) 		包装体积
1003391A (96 rxn)

NadPrep UDI-Index Primer Mix II # 12×15 µL 24×25 µL 24×25 µL 96×8 µL

NadPrep Methyl Stubby Adapter II 60 µL 230 µL 230 µL 260 µL

NadPrep Amplification Primer Mix II
 20 µL
 75 µL
 75 µL
 75 µL

NadPrep® 快速 RNA 文库构建试剂盒分为常规性文库和链特异性文库，两者有什么区别？

转录组测序 (RNA-Seq) 文库制备一般分为常规性和链特异性两类，其核心差异在于是否在测序文库中保留转录本的方向性信息。其中，链特异性文库在制备过程中保留了转录本的方向性，测序与下游分析时可判定转录本来源于 DNA 的正义链还是反义链；而常规性文库在 cDNA 合成过程中会丢失方向性信息，测序数据无法直接区分转录方向。与常规性 RNA-Seq 相比，链特异性 RNA-Seq 更能准确地统计转录本数量，明确基因结构，同时识别反义转录本以及发现更多新转录本，因此是研究基因结构与表达调控的重要手段。总体而言，文库制备方法的选择应基于实验目的、成本预算及参考转录组的可用性等因素；若需获取转录本方向性信息，应优先选择链特异性文库。无论选择何种方案，均应严格按照试剂盒使用说明书执行相应操作以确保数据质量。

类别 产品 详情 货号
甲基化建库模块 NadPrep® Methyl Library Preparation Module v2, 24 rxn 24 rxn 1002511
NadPrep® Methyl Library Preparation Module v2, 96 rxn 96 rxn 1002512
BS 转化模块 NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module, 24 rxn 24 rxn 1002701
NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module, 96 rxn 96 rxn 1002702
甲基化单标签接头模块 (for MGI) NadPrep® Methyl Adapter (SI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn SI 1-12 1003631
NadPrep® Methyl Adapter (SI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn SI 1-24 1003632
NadPrep® Methyl Adapter (SI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn SI 25-48 1003633
甲基化双端唯一接头模块 (for MGI) NadPrep® Methyl Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn MDI 1-12 1003740
NadPrep® Methyl Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn MDI 1-24 1003741
NadPrep® Methyl Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn MDI 25-48 1003742
NadPrep® Methyl Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn MDI 49-72 1003743
NadPrep® Methyl Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn MDI 73-96 1003744
甲基化截短型双端唯一 接头模块 (for Illumina®) NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module v2 Set A1 (for Illumina®), 24 rxn UDI 1-12 1003371A
NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module v2 Set B1 (for Illumina®), 96 rxn UDI 1-24 1003381A
NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module v2 Set B2 (for Illumina®), 96 rxn UDI 25-48 1003382A
NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module v2 Set E1 (for Illumina®), 96 rxn UDI 1-96 1003391A




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