μCaler® FS EMS+ Panel v1.0

产品特色

• 样本兼容：适用于 gDNA、cfDNA 及不同等级的 FFPE 样本。
• 稳定可靠：采用独家专利型 μCaler® 探针设计，全面检测甲基化状态，结果稳定可靠。
• 精准定量：确保不同甲基化状态 (0% ~ 100%) 的样本实现准确且稳定的甲基化水平定量。
• 高效捕获：无需序列转化，充分保留原始序列丰富度，数倍提高有效覆盖深度。
• 灵活定制：针对特定单一/多癌种，支持定制包含不同规模 CpG 位点或不同基因突变的探针包。

产品表现

CpG 有效覆盖深度

图 1. μCaler® FS EMS Panel+ v1.0 对不同甲基化水平模拟样本的 CpG 平均覆盖深度 (去重后)。模拟样本利用 μCaler® DNA Full Screen System 全流程解决方案和 μCaler® FS EMS+ Panel v1.0 完成杂交捕获，测序模式分别为 DNBSEQ-T7，PE150 和 NovaSeq 6000，PE150。随机选取 1 M reads pair 进行数据分析。

注：甲基化阳性对照 100% Methylated DNA (zymo, D5014-2) 和阴性对照 0% Methylated DNA (zymo, D5014-1)，经不同比例混合以模拟不同甲基化水平 (0%，10%，50% 和 100%)，样本起始投入量为 50 ng。

精准定量甲基化水平

图 2. μCaler® FS EMS+ Panel v1.0 对不同甲基化水平的模拟样本精准定量。A. 理论甲基化水平与实际检测到的甲基化水平的比较；B. 靶区域 CpG 位点的甲基化水平。

保持甲基化检测的高稳定性

图 3. μCaler® FS EMS+ Panel v1.0 对同一样本两次重复之间检出甲基化水平的相关性分析。A-D. 4 例独立样本两次重复检测的甲基化水平相关性。随机选取 4 例临床结直肠癌组织样本利用 μCaler® DNA Full Screen System 全流程解决方案和 μCaler® FS EMS+ Panel v1.0 完成杂交捕获。相关性检测结果中 R² 分布范围为 0.8007 ~ 0.9707。
注：样本起始投入量为 20 ng。

有效区分肿瘤和癌旁组织

图 4. μCaler® FS EMS+ Panel v1.0 应用于临床结直肠癌及其癌旁组织时的甲基化水平检出情况。A. 结直肠癌配对样本 CpG 甲基化水平；B. 结直肠癌候选 Biomarkers 在临床样本中的 CpG 甲基化水平。
注：CRCA: Colorectal Cancer；Pt: Peritumoral tissue。

基因列表

肺癌

BCAT1

CDH1

CDKN2A

CDO1

DMRTA2

FOXD3

FOXI2

GATA5

GDNF

HOXA7

HOXA9

OPCML

PAX5

PTGER4

RASSF1

SCT

SHOX2

SIX6

SLC12A8

SOX17

ST6GALNAC5

SULF2

TAC1

TNFRSF25

ZFP42

结直肠癌*

ADHFE1

ALX4

ASCL1

BCAT1

BMP3

C1QL3

CNRIP1

EYA4

FBN1

FGF5

IKZF1

INA

MAL

NDRG4

NPY

OPCML

RARB

SDC2

SEPTIN9

SFRP2

SIX6

SNCA

SOX1

SPART

ST6GALNAC5

TAC1

TFPI2

TM6SF1

VAV3

胃癌

ADRA1B

ARHGAP20

ASCL1

C1QL3

CABIN1

CD40

CPEB1

DLGAP3

DOCK10

ELMO1

HOPX

HOXD11

KCNQ5

LMX1A

RNF180

RORB

RPRM

RUBCNL

RUNX3

SDC2

SEPTIN9

TCF4

TFPI2

ZNF569

肝癌

ALX3

ARHGEF33

C1QL3

CDKL2

CFTR

DCDC2

EVX1

FAR1

HOXA11

HOXA9

MTHFD2

PLAC8

RIPK3

RUNX3

SEPTIN9

SGIP1

SH3YL1

SIX6

SOX1

TAMALIN

TBX15

WNT3A

ZNF605

乳腺癌

APC

ASCL1

BRCA1

C1QL3

CPXM1

DKK3

GALR1

HOXA10

HOXA9

ITIH5

LBX1

OTP

PITX2

RARB

RASGRF1

SOX1

USP44

膀胱癌

EOMES

FEZF2

HAND2

IRAK3

IRX4

LRRC4

NID2

NOVA1

NRN1

ONECUT2

OTX1

PENK

PIGG

SOX1

TAC1

TCERG1L

TMEFF2

TWIST1

VIM

前列腺癌

AKR1B1

ANXA2

AOX1

APC

CFAP90

GDAP1L1

GSTP1

HAAO

PRKCB

PTGS2

RARB

RUNX3

SEPTIN9

SIX6

TAC1

宫颈癌

ASCL1

ASTN1

C1QL3

CHAD

CHRM2

DLX1

EDN3

EPB41L3

FGF10

HOXA9

ITGA4

ITGA8

JAM3

OPCML

PAX1

PCDHGB7

RXFP3

SEPTIN9

SIX6

SOX1

SOX17

ST6GALNAC5

TAC1

TAFA4

TFPI2

ZNF582

ZNF781

ZSCAN1

卵巢癌

CDH13

CDO1

GYPC

HNF1B

HOXA11

HOXA9

IFFO1

LOC284798

LYPD5

OPCML

PAX1

PCDH17

PCDHB18P

RASSF1

RYBP

SOX1

TAC1

ZNF671

食管癌

ASCL1

CCNA1

EPO

HOXC10

HOXD1

KCNA3

MAFB

MT1A

MT1G

OPCML

RAB37

RAPGEFL1

SEPTIN9

SIX6

ST3GAL6

ST6GALNAC5

TAMALIN

TFPI2

ZNF132

ZNF154

ZNF582

*此外还覆盖了表中未列出的基因间区 (Intergenic，含 12 个 CpG 位点)。

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。