NadPrep® IGTR 多重扩增文库构建试剂盒
#1300002
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产品特色
● 模块化引物设计
提供 IG (IG Primer Mix) 和 TR (TR Primer Mix) 两种独立引物组合：IG 管覆盖 IGH/IGL/IGK 基因特异性引物，TR 管覆盖 TRA/TRB/TRG/TRD 基因特异性引物；
支持单管独立检测 (仅 IG 或 TR) 或双管联合检测 (IG + TR)。
● 灵活兼容
样本类型——人类 gDNA 或 cDNA (RNA 经逆转录生成的一链 cDNA 即可) 样本均可；
起始投入量——兼容 50-2000 ng 的广泛投入量；
测序平台——支持 Illumina® 平台直接测序或环化后在 MGI 平台测序。
实验流程
产品表现
IG/TR 引物分管灵活组合，精准扩增靶区域
在 2 μg 白细胞来源的 gDNA 中掺入十万分之一 (0.001%) 的 RAMOS 和 JURKAT 细胞系混合 gDNA，采用 NadPrep® IGTR 多重扩增文库构建试剂盒进行文库构建，分别以 IG 或 TR 单管独立扩增和 IG + TR 双管联合扩增。
表 1. 配套分析工具输出的克隆列表。
图 1. NadPrep® IGTR 多重扩增文库构建试剂盒 CDR3 多样性分析。
注： 测序模式为 NovaSeq 6000，PE150。分析数据量为 2~2.4 Gb。A. IG Primer Mix 单管 (中靶率 86.49%)；B. TR Primer Mix 单管 (中靶率 93.36%)；C. IG Primer Mix 和 TR Primer Mix 双管 (中靶率 91.62%)。
| 包装编号 | 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1300001 (6 rxn) |
包装体积 1300002 (96 rxn) |
| Box 1 |
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2X Multiplex PCR Mix | 180 μL | 2×1600 μL |
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IG Primer Mix | 15 μL | 230 μL | |
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TR Primer Mix | 15 μL | 230 μL | |
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Multiplex Index Primer Mix # | 6×5 μL | 24×10 μL | |
| Box 2 |
/ |
NadPrep SP Beads | 400 μL | 6400 μL |
转录组测序 (RNA-Seq) 文库制备一般分为常规性和链特异性两类，其核心差异在于是否在测序文库中保留转录本的方向性信息。其中，链特异性文库在制备过程中保留了转录本的方向性，测序与下游分析时可判定转录本来源于 DNA 的正义链还是反义链；而常规性文库在 cDNA 合成过程中会丢失方向性信息，测序数据无法直接区分转录方向。与常规性 RNA-Seq 相比，链特异性 RNA-Seq 更能准确地统计转录本数量，明确基因结构，同时识别反义转录本以及发现更多新转录本，因此是研究基因结构与表达调控的重要手段。总体而言，文库制备方法的选择应基于实验目的、成本预算及参考转录组的可用性等因素；若需获取转录本方向性信息，应优先选择链特异性文库。无论选择何种方案，均应严格按照试剂盒使用说明书执行相应操作以确保数据质量。
| 类别 | 产品 | 详情 | 货号 |
|
多重扩增 建库模块 |
NadPrep® IGTR Multiplex Library Prep Kit, 6 rxn | Index #1-6 | 1300001 |
| NadPrep® IGTR Multiplex Library Prep Kit, 96 rxn | Index #1-24 | 1300002 |
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