μCaler® EMS Panel v1.0

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#1101501
#1101502

μCaler® EMS Panel v1.0 (Early Methylation for Screening) 精选了经 NMPA 和 FDA 批准的位点，同时囊括了文献和专利报道中具有重要意义的位点，共计 2097 个 CpG 位点。覆盖 9 大高发癌种，包括肺癌、结直肠癌、胃癌、肝癌、乳腺癌、膀胱癌、前列腺癌、宫颈癌、卵巢癌，涉及 76 个与致癌和肿瘤抑制相关的甲基化候选基因。探针设计涵盖基因组约 20 Kb 区域，为全面且精准的甲基化早筛提供支持。

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基因列表

癌种	Biomarker
肺癌 (Lung Cancer)	SCT、HOXA7、RASSF1、SHOX2、PTGER4
结直肠癌 (Colorectal Cancer)	NDRG4、BCAT1、Septin9、BMP3、TFPI2、SDC2、SFRP2
胃癌 (Gastric Cancer)	Septin9、RNF180、TCF4、RPRM、SDC2、TERT
肝癌 (Liver Cancer)	SCN4B、BDH1、HOXA10、PLAC8、BMPR1A、TEPP、SPACA6、MIXL1、TSC22D1
乳腺癌 (Breast Cancer)	CDO1、PITX2、GSTP1、GP5、APC
膀胱癌 (Bladder Cancer)	SOX1、GALR1、DMRTA2、EVX2、SOX17、DCHS2、TWIST1、TBX5、HOXA11、SIM2、LHX2
前列腺癌 (Prostatic Cancer)	CCND2、CDH1、MCAM、PENK、PITX2、PTGS2、RARB、LINC02028、SLCO3A1、HES5、TPM4、FHAD1、SOX1-OT、IGFBP3、ZNF154、FEZF2、APC
宫颈癌 (Cervical Cancer)	SOX1、PAX1、JAM3、TAFA4、ASTN1、DLX1、ITGA4、RXFP3、SOX17
卵巢癌 (Ovarian Cancer)	PCDHB18P、CDO1、HOXA9、LYPD5、CDH13、FOXD3、ZNF671、HOXA11、FBXO32、OPCML、BLACAT1、LRRC41、GNE、FAIM2、CAPN2、SIM2

产品特色

多癌种检测：一次性覆盖 9 大癌种多基因的 CpG 位点。
多样本兼容性：适用于 gDNA、cfDNA 和不同等级的 FFPE 样本。
精准定量甲基化水平：实现对肿瘤及癌旁组织甲基化水平的准确定量。
高效捕获技术：结合 μCaler^® Total Solution for Methylation，确保数据质量均一，捕获效率和稳定性更高。
可靠性高：采用独家专利型探针设计，全面检测甲基化状态，提供可靠的结果。
稳定交付周期：自有核酸工厂，现货交付，保障交货周期的稳定性。
灵活定制：针对特定单一/多癌种，支持定制包含不同基因及不同规模 CpG 位点的 Panel 单独使用或者 Spike-in。

产品表现

兼容不同样本类型

图 1. μCaler^® EMS Panel v1.0 应用于 gDNA 及 cfDNA 样本时的捕获表现。A. gDNA 样本；B. cfDNA 样本；C. Fold 80 base penalty；D. gDNA 样本靶区域 CpG total depth (去重后)。使用 NadPrep^® Methyl Library Preparation Module 分别对样本进行预文库构建，gDNA 使用 NadPrep^® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module (BS) 进行甲基化文库转化，cfDNA 分别使用 BS 和酶学 (EM) 两种方式进行甲基化文库转化，500 ng/预文库投入，以 μCaler^® Hybrid Capture Reagents v2 和 μCaler^® EMS Panel v1.0 完成杂交捕获。
注：gDNA 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471)，投入量 50 ng；cfDNA 样本为血浆 cfDNA，投入量 20 ng。

图 2. μCaler^® EMS Panel v1.0 应用于不同等级 FFPE 样本时的捕获表现。A. 捕获表现；B. Fold 80 base penalty。使用 NadPrep^® Methyl Library Preparation Module 分别对样本进行预文库构建，衔接 NadPrep^® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module 进行甲基化文库转化，500 ng/预文库投入，以 μCaler^® Hybrid Capture Reagents v2 和 μCaler^® EMS Panel v1.0 完成杂交捕获。
注：FFPE 为临床肺癌样本，投入量 50 ng。样本分级标准：FFPE B：15 Kb 左右有主带，但存在中度弥散；FFPE C：条带主要分布在 200-2500 bp，呈弥散状；FFPE D：条带主要分布在 100-1000 bp，呈弥散状。

临床样本检测表现

结直肠癌

图 3. μCaler^® EMS Panel v1.0 应用于临床结直肠癌及其癌旁组织时的捕获表现。A. 中靶率 & 比对率；B. CpG 覆盖度；C. Fold 80 base penalty。
注：CRC: Colorectal Cancer。

图 4. μCaler^® EMS Panel v1.0 应用于临床结直肠癌及其癌旁组织时的甲基化水平检出情况。A. 结直肠癌配对样本 CpG 甲基化水平；B. 结直肠癌候选 Biomarker 在临床样本中的 CpG 甲基化水平。
注：CRC: Colorectal Cancer；Pt: Peritumoral tissue。

卵巢癌

图 5. μCaler^® EMS Panel v1.0 应用于临床卵巢癌及其癌旁组织时的甲基化水平检出情况。A. 卵巢癌配对样本 CpG 甲基化水平；B. 卵巢癌候选 Biomarker 在临床样本中的 CpG 甲基化水平。
注： OVCA: Ovarian Cancer；Pt: Peritumoral tissue 。

肺癌

图 6. μCaler^® EMS Panel v1.0 应用于临床肺癌组织时的甲基化水平检出情况。A. 肺癌样本 CpG 甲基化水平；B. 肺癌样本 CpG 深度; C. 肺癌候选 Biomarker 在临床样本中的 CpG 甲基化水平。
注：LC: Lung Cancer。

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

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产品名称

包装

体积

包装/储存温度

1101502

μCaler® EMS Panel v1.0, 16 rxn

40 μL

-25~-15℃

1101501

μCaler® EMS Panel v1.0, 96 rxn

210 μL

-20~-15℃

NadPrep® 快速 RNA 文库构建试剂盒分为常规性文库和链特异性文库，两者有什么区别？

转录组测序 (RNA-Seq) 文库制备一般分为常规性和链特异性两类，其核心差异在于是否在测序文库中保留转录本的方向性信息。其中，链特异性文库在制备过程中保留了转录本的方向性，测序与下游分析时可判定转录本来源于 DNA 的正义链还是反义链；而常规性文库在 cDNA 合成过程中会丢失方向性信息，测序数据无法直接区分转录方向。与常规性 RNA-Seq 相比，链特异性 RNA-Seq 更能准确地统计转录本数量，明确基因结构，同时识别反义转录本以及发现更多新转录本，因此是研究基因结构与表达调控的重要手段。总体而言，文库制备方法的选择应基于实验目的、成本预算及参考转录组的可用性等因素；若需获取转录本方向性信息，应优先选择链特异性文库。无论选择何种方案，均应严格按照试剂盒使用说明书执行相应操作以确保数据质量。

产品	货号
μCaler® EMS Panel v1.0, 16 rxn	1101502
μCaler® EMS Panel v1.0, 96 rxn	1101501

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

产品资料

应用指南

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μCaler_EMS_Panel_gDNA_G1471_Illumina

人类基因组 DNA (Promega, G1471)，以 NadPrep® 甲基化文库构建试剂盒及 NadPrep® DNA 甲基化亚硫酸氢盐转化模块构建预文库，μCaler® EMS Panel v1.0 与 μCaler® Hybrid Capture Reagents v2 靶向捕获的测试数据。

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