NEX-t Panel v1.0 捕获中靶率表现如何？是否需要进行两轮杂交来提高中靶率？

• 病原捕获的中靶率受到病原含量的影响较大。如下图所示，在相同的宿主背景下，随着微生物参考品的梯度稀释，其数据量呈等比例下降的趋势，而中靶率也随之降低。
• 尽管多轮捕获能够显著地提高中靶率，但这种策略同时伴随着信息丢失 (dropout) 的风险。尤其在病原含量较低的情况下，中靶率低，同时也对 dropout 更为敏感。因此，在考虑多轮捕获时需要谨慎权衡利弊。此外，从另一个角度来看，当样本中的病原基因组拷贝数为个位数时，提高中靶率实际上只是将这几个拷贝反复测序，并未产生更多的有用信息。

注：以人类基因组 DNA 标准品 (Promega，G1471) 按照不同比例对 20 菌株交错的混合基因组材料 (ATCC，MSA-1003) 进行稀释以获得 0.001%-1% MSA-1003 的模拟菌群样本。50 ng Input 以 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 建库，利用 NEX-t Panel v1.0 搭配 NadPrep®️ ES Hybrid Capture Reagents 完成杂交捕获 (杂交 2 h)。测序模式：Novaseq6000， PE150。

测序数据利用 BWA 比对到由 hg19 人类基因组和 20 种微生物基因组参考序列组成的参考基因组，统计 reads 分布。