NadPrep®️ 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2
#1002602
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产品特色
● 适用于多类型样本，包括：gDNA、FFPE B+/B/C/D 级 DNA 样本
● DNA 片段化长度灵活可控
● 片段化、末端修复和加 A 一步完成，体系灵活、操作简便
● 文库产出稳定高效，覆盖均一，低 GC 偏好性
● 低背景噪音（酶切副产物引入的异常序列）
● 兼容自动化工作站平台
建库流程
产品表现
文库产出稳定高效
图 1. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 对不同起始量 gDNA 样本的建库产出。NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v2 (NadPrep® Enfrag v2) 分别搭配 A. NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 和 NadPrep® UDI Adapter Module (for Illumina®) 和 B. NadPrep® Universal Adapter (SI) Module (for MGI) 和 NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 构建文库，酶切 25 min，文库扩增参考推荐循环数。
兼容不同类型样本
图 2. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 对不同类型样本的建库产出。NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v2 分别搭配 A. NadPrep® UDI Adapter Module (for Illumina®) 和 B. NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 构建文库，酶切时间和扩增循环数文库扩增参考相应说明书。
注：样本分级标准 | gDNA：~ 15 kb 有明亮单一不拖尾条带；FFPE B+：~ 15 kb 有主带，存在轻微弥散，主带比弥散状带明显；FFPE B：~ 15 kb 有隐约可见主带，同时存在中度弥散；FFPE C：条带主要分布在 200-2500 bp，呈弥散状；FFPE D：条带主要分布在 250-1000 bp，呈弥散状。
片段化长度灵活可控
图 3. 不同类型样本在不同酶切条件下的文库片段分布。A. 250 ng gDNA 样本为起始量，利用 NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v2 搭配 NadPrep® UDI Adapter Module (for Illumina®) 构建文库，参照说明书，酶切不同时间，以获得不同长度 DNA 片段；B. 50 ng 不同等级的 FFPE DNA 样本为起始量构建文库，参照说明书，酶切不同时间，以获得 250 bp DNA 片段。
低 GC 偏好性
图 4. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 对宏基因组样本的建库表现。微生物群组 DNA 标准品 (Zymo Research, D6306）经不同文库制备方案比较微生物的检测情况，NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 的 GC 偏好性跟超声片段化文库构建试剂盒相比无明显差异。
注：NadPrep® Sonication: NadPrep® DNA 通用型文库构建模块 (for Illumina®)； NadPrep® Enfrag v2: NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建模块 v2 ，均搭配 NadPrep® UDI Adapter Module (for Illumina®)。
引入背景噪音较低
图 5. 不同类型样本经不同文库构建试剂盒建库时文库产出中异常 reads 的占比。gDNA 及不同等级的 FFPE DNA 样本以 50 ng 为起始量，分别采用 NadPrep® Sonication: NadPrep® DNA 通用型文库构建模块 (for Illumina®) 、NadPrep® Enfrag v2: NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建模块 v2、Vendor Q *、 Vendor K* 和 Vendor V* 酶切片段化文库构建试剂盒建库，500 ng 同一建库方案的文库杂交，并通过 NanOnco Plus Panel v2.0 完成捕获，按照 total reads 计算。A. gDNA 样本经不同文库构建方案建库的文库产出及文库中异常 reads 占比 (Illumina 平台)；B. 不同等级 FFPE DNA 样本经酶切片段化文库构建试剂盒建库时文库产出中异常 reads 占比 (MGI 平台)。
注：Artifact rate: 酶切副产物引入的异常序列占比。
优异的靶向捕获表现
图 6. 酶切和超声片段化构建文库的捕获表现。50 ng 不同等级的 FFPE DNA 样本分别进行酶切和超声片段化建库，500 ng 同一建库方案的文库杂交，并以 NanOnco Plus Panel v2.0 (2.6 M) 搭配 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 和 NadPrep® NanoBlockers (for Illumina®) 组成完整的杂交捕获方案，测序数据取 2 M reads pair 分析，不同建库方案的文库捕获数据在 A. 比对率和中靶率方面的表现基本保持一致，但在 B. Fold 80 penalty，C. Duplication rate (重复率) 和 D. Mate on differ chr (自连率) 方面的表现均优于竞品。
文库构建模块
| 包装编号 | 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1002601(24 rxn) |
包装体积 1002602 (96 rxn) |
| Box1 |
|
FERA Buffer | 150 µL | 575 µL |
|
|
FERA Enzyme | 150 µL | 575 µL | |
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Enhancer Buffer | 250 µL | 950 µL | |
|
|
Ligation Buffer | 750 µL | 2×1500 µL | |
|
|
DNA Ligase | 60 µL | 230 µL | |
|
|
2X HiFi PCR Master Mix | 720 µL | 2×1600 µL | |
|
/ |
Nuclease Free Water | 2.5 mL | 8 mL | |
|
|
TE Solution | 1 mL | 4 mL | |
| Box2 |
/ |
NadPrep SP Beads | 4 mL | 15 mL |
单端接头模块 (for MGI)
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003611 (24 rxn) |
包装体积 1003621 (96 rxn) |
包装体积 1003622(96 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (SI) Primer Mix # | 12×15 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Adapter (SI) | 60 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003641 (96 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (SI) Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) |
|
|
NadPrep M-Adapter (SI) | 260 µL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, SI) | 75 µL (Tube) |
双端唯一接头模块 (for MGI)
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003711 (24 rxn) |
包装体积 1003721 (96 rxn) |
包装体积 1003722 (96 rxn) |
包装体积 1003725 (96 rxn) |
包装体积 1003726 (96 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 12×15 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Adapter (DI) | 60 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003751 (96 rxn) |
包装体积 1003752 (96 rxn) |
包装体积 1003753 (96 rxn) |
包装体积 1003754 (96 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) |
|
|
NadPrep M-Adapter (DI) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003761 (1152 rxn) |
包装体积 1003762 (1152 rxn) |
包装体积 1003763 (1152 rxn) |
包装体积 1003764 (1152 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Adapter (DI) | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) |
通用截短型双端唯一接头模块
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003240 (24 rxn) |
包装体积 1003241 (96 rxn) |
包装体积 1003242 (96 rxn) |
|
|
NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 12×15 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) |
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|
NadPrep Universal Stubby Adapter | 60 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) |
|
|
NadPrep Amplification Primer Mix II | 20 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003251 (96 rxn) |
包装体积
1003252 (96 rxn) |
包装体积
1003253 (96 rxn) |
包装体积
1003254 (96 rxn) |
|
|
NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) |
|
|
NadPrep Universal Stubby Adapter | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) |
|
|
NadPrep Amplification Primer Mix II | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003261 (1152 rxn) |
包装体积
1003262 (1152 rxn) |
包装体积
1003263 (1152 rxn) |
包装体积
1003264 (1152 rxn) |
|
|
NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) |
|
|
NadPrep Universal Stubby Adapter | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) |
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|
NadPrep Amplification Primer Mix II | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) |
全长型双端唯一接头模块（for Illumina）
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003211 (24 rxn) |
包装体积 1003222 (24 rxn) |
包装体积 1003211 (96 rxn) |
包装体积 1003212 (96 rxn) |
包装体积 1003213 (192 rxn) |
包装体积 1003224* (480 rxn) |
|
|
NadPrep UDI Adapter # | 12×10 µL (Tube) | 12×10 µL (Tube) | 12×22 µL (Tube) | 12×22 µL (Tube) | 24×22 µL (Tube) | 96×3.5 µL (Plate)×5 |
| 类别 | 产品 | 详情 | 货号 |
| 建库模块 | NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v2, 24 rxn | 24 rxn | 1002601 |
| NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v2, 96 rxn | 96 rxn | 1002602 | |
| 截短型单端接头模块 | NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn | SI 1-12 | 1003611 |
| NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn | SI 1-96 |
1003641 |
|
| NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn | SI 1-24 | 1003621 | |
| NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn | SI 25-48 | 1003622 | |
| 截短型双端唯一接头模块 | NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn | MDI 1-12 | 1003711 |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn | MDI 1-24 | 1003721 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn | MDI 25-48 | 1003722 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn | MDI 49-72 | 1003725 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn | MDI 73-96 | 1003726 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn | MDI 1-96 | 1003751 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E2 (for MGI), 96 rxn | MDI 97-192 | 1003752 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E3 (for MGI), 96 rxn | MDI 193-288 | 1003753 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E4 (for MGI), 96 rxn | MDI 289-384 | 1003754 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F1 (for MGI), 1152 rxn | MDI 1-96 | 1003761 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F2 (for MGI), 1152 rxn | MDI 97-192 | 1003762 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F3 (for MGI), 1152 rxn | MDI 193-288 | 1003763 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F4 (for MGI), 1152 rxn | MDI 289-384 | 1003764 | |
| 通用截短型双端唯一接头模块 | NadPrep® Universal Syubby Adapter (UDI) Module Set A1, 24 rxn | Index 1-12 | 1003240 |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B1, 96 rxn | Index 1-24 | 1003241 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B2, 96 rxn | Index 25-48 | 1003242 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E1, 96 rxn | Index 1-96 | 1003251 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E2, 96 rxn | Index 97-192 | 1003252 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E3, 96 rxn | Index 193-288 | 1003253 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E4, 96 rxn | Index 289-384 | 1003254 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F1, 1152 rxn | Index 1-96 | 1003261 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F2, 1152 rxn | Index 97-192 | 1003262 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F3, 1152 rxn | Index 193-288 | 1003263 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F4, 1152 rxn | Index 289-384 | 1003264 | |
| 全长型双端唯一接头模块 | NadPrep® UDI Adapter Kit Set A (for Illumina®), 96 rxn |
Index
1-12 300 pmol / 接头 |
1003211 |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set B (for Illumina®), 96 rxn |
Index
13-24 300 pmol / 接头 |
1003212 | |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set A&B (for Illumina®), 192 rxn |
Index
1-24 300 pmol / 接头 |
1003213 | |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set C1 (for Illumina®), 24 rxn |
Index
1-12 24 rxn |
1003221 | |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set D1 (for Illumina®), 480 rxn |
Index
1-96 480 rxn |
1003224 |
产品资料
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NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2
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文库构建模块和接头模块参考指南 (for MGI)
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文库构建模块和接头模块参考指南 (for Illumina®)
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[使用说明] -
MDI Index Sequence
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[使用说明] -
Universal Stubby Adapter (UDI) Index Sequence
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[使用说明] -
UDI Adapter & Index Sequence
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[使用说明] -
NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 使用说明书 (for MGI)
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[使用说明] -
NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 使用说明书 (for Illumina®)
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