OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0
#1001512
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基因列表及覆盖区域信息 |
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ABL1*† |
ABL2 |
AKT3 |
ALK |
ARHGAP26 |
AXL |
BCL2† |
BCOR* |
BRAF |
BRD3* |
BRD4* |
CAMTA1 |
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CCNB3* |
CCND1 |
CIC† |
COL6A3 |
CSF1R |
DNAJB1 |
EGFR |
EML4 |
EPC1* |
ERBB2† |
ERG* |
ESR1 |
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ETS1 |
ETV1* |
ETV4 |
ETV5* |
ETV6* |
EWSR1 |
FGFR1 |
FGFR2 |
FGFR3 |
FGR* |
FLI1 |
FLT3 |
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FOSB |
FOXO1 |
FUS |
GLI1 |
HMGA2 |
INSR |
JAK2* |
JAK3 |
JAZF1 |
KIF5B† |
KIT† |
KMT2A |
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MAML2 |
MAST1 |
MAST2 |
MEAF6 |
MET* |
MLLT3 |
MSH2 |
MSMB† |
MUSK |
MYB |
MYC |
NCOA1* |
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NCOA2* |
NOTCH1 |
NOTCH2 |
NOTCH3† |
NR4A3* |
NRG1 |
NTRK1 |
NTRK2 |
NTRK3 |
NUMBL |
NUTM1 |
PAX3 |
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PAX7 |
PDGFB |
PDGFRA |
PDGFRB† |
PHF1* |
PIK3CA* |
PKN1 |
PLAG1* |
PPARG* |
PRKACA |
PRKCA |
PRKCB |
|
RAF1 |
RARA* |
RELA |
RET |
ROS1 |
RSPO2* |
RSPO3 |
SS18 |
STAT6* |
TAF15 |
TCF12† |
TCF3 |
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TERT |
TFE3 |
TFEB |
TFG |
THADA |
TMPRSS2*† |
TP53* |
USP6* |
YWHAE* |
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* 覆盖全部 5'-UTR；†覆盖全部 3'-UTR。
产品表现
捕获表现
图 1. OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 的捕获表现。A. 典型的捕获测序数据组成，B. 捕获测序与RNAseq数据靶基因相对丰度的比较。 Human Brain Total RNA 标准品 (HBR，Clontech，货号：636530) 利用 NadPrep® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒系列建库，分别进行：直接测序 (RNAseq)，或 RNA 捕获测序 (OncoFu E)。
融合检测示例
图 2.OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 应用于 FFPE 融合 RNA 参考品的基因融合分析示例。A. OncoFu E 靶向富集与 RNAseq 的比较；B. 参考品倍数稀释后OncoFu E 的靶向富集表现。100 ng Seraseq® FFPE Tumor Fusion RNA v4 Reference Material利用 NadPrep® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒系列建库，分别进行：直接测序 (RNAseq)，去除 rRNA 测序 (rRNA-depleted RNAseq，NEBNext rRNA Depletion Kit v2) 和 RNA 捕获测序 (OncoFu E)，并取 1 Gb 数据量进行融合分析 (FusionCatcher v1.10)。
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
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货号 |
管盖
颜色 |
产品名称 |
包装
体积 |
包装/储存温度 |
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1001512 |
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OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 16 rxn |
70 μL |
-20℃ |
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1001511 |
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OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 96 rxn |
415 μL |
-20℃ |
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1001513 |
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OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 480 rxn |
415 μL × 5 |
-20℃ |
1、Intron 区 repeats 无法放置探针；
2、Intron 区跨度巨大，需放置大量探针;
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产品 |
货号 |
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OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 16 rxn |
1001512 |
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OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 96 rxn |
1001511 |
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OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 480 rxn |
1001513 |
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