NEXome Core Panel

货号：

#1001852（16 rxn）
#1001851（96 rxn）

NEXome Core Panel 在最新版本 Refseq（109，2021）和 CCDS 数据库的基础上，额外精心挑选了一些数据库之外值得关注的区域，同时基于产品延续性的考虑保留了部分最新版数据库中删去的区域。NEXome Core Panel 包含约 40 万条单独合成、单独质控的单链 DNA 探针，靶向 34.7Mb 基因组区域（19,613 基因）。 NEXome Core Panel 作为一款核心全外显子 Panel，可与不同的子 panel 组合搭配，满足不同的应用需求。

获取报价

产品详情
产品组分
常见问题
订购信息
资料下载

生产质量与控制

单独合成单独质控

图 1. NEXome Core Panel 单条探针的质谱检测结果。理论分子量为 37542.9 Da，质谱检测结果显示，实测分子量为 37538.6 Da。

表 1. 每条探针分析的检测示例。

产品性能

捕获表现

图 2. NEXome Core Panel 对不同 gDNA 文库的捕获表现。
A. 捕获数据比对率和捕获效率； B. 靶区域覆盖度；C. 覆盖均一性和一致性；D. GC 偏好性。300 ng gDNA 利用 NadPrep^® 文库构建系列试剂盒建库，以 NEXome Core Panel (6 plex) 完成杂交捕获。利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，按照 reads 数计算。测序平台：Illumina Novaseq 6000，PE150；DNBSEQ-T7，PE150。
注：Male：人类男性基因组 DNA (Promega-Male, G1471)；Female：人类女性基因组 DNA (Promega-Female, G1521)。

变异一致性分析

图 3. NEXome Core Panel 捕获数据中变异频率与标准品频率的一致性。

利用 NadPrep^® 文库构建系列试剂盒建库，以 NEXome Core Panel 完成杂交捕获，Vardict 进行变异分析。测序平台：Illumina Novaseq 6000，PE150；DNBSEQ-T7，PE150。

注：样本为泛肿瘤 800 gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM800)，投入量 100 ng。

竞品比较

图 4. 不同外显子组 Panel 对不同 gDNA 文库的捕获效率和靶区域覆盖均一性的比较。

A. 捕获中靶率；B. 靶区域覆盖均一性；C. 靶区域覆盖深度。利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，按照 reads 数计算。测序平台：Illumina Novaseq 6000，PE150。

图 5. 相同测序数据量下不同全外显子组 Panel 在 80% 靶区域可达到的覆盖深度。

图 6. NEXome Core Panel 实际覆盖情况示例。

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

货号

管盖

颜色

产品名称

包装

体积

包装/储存温度

1001852

NEXome Core Panel, 16 rxn

70 μL

–20℃

1001851

NEXome Core Panel, 96 rxn

415 μL

–20℃

NadPrep® 快速 RNA 文库构建试剂盒分为常规性文库和链特异性文库，两者有什么区别？

转录组测序 (RNA-Seq) 文库制备一般分为常规性和链特异性两类，其核心差异在于是否在测序文库中保留转录本的方向性信息。其中，链特异性文库在制备过程中保留了转录本的方向性，测序与下游分析时可判定转录本来源于 DNA 的正义链还是反义链；而常规性文库在 cDNA 合成过程中会丢失方向性信息，测序数据无法直接区分转录方向。与常规性 RNA-Seq 相比，链特异性 RNA-Seq 更能准确地统计转录本数量，明确基因结构，同时识别反义转录本以及发现更多新转录本，因此是研究基因结构与表达调控的重要手段。总体而言，文库制备方法的选择应基于实验目的、成本预算及参考转录组的可用性等因素；若需获取转录本方向性信息，应优先选择链特异性文库。无论选择何种方案，均应严格按照试剂盒使用说明书执行相应操作以确保数据质量。

NEXome 多杂表现如何？

以下是 12 杂 1 的实际表现（男性 gDNA 和女性 gDNA 各 6 个文库，500 ng/文库，取 25 M reads pair 数据分析）