直播预告 | NGS 文库制备的痛点及应对：困难样本如何成功建库？

浏览量：937 / 发布时间：2024-05-28

直播简介

文库制备是所有 NGS 工作流程中至关重要的一环，可通过 dsDNA 或 ssDNA 文库构建等来完成。其中，dsDNA 文库制备常见的接头连接方式包括：T-A 连接，转座酶，分步连接和平末端连接。然而，dsDNA 文库制备方法在处理较短片段 DNA、降解 DNA、ssDNA 以及带有碱基损伤、切刻、缺口的 DNA 样本时，效果往往不佳。相较之下，ssDNA 文库制备方法已被证明能够有效保留更多较短、降解和碎片化的 DNA 信息，被认为是处理低质量、微量或降解较为严重的样本进行文库构建的可靠途径。单链建库技术摆脱了传统基于双链 T/A 连接的依赖，因此不再受限于 DNA 末端完整性、双链完整性、DNA 起始量以及接头/样本浓度比例等多种因素，从而实现了 DNA 连接效率以及 DNA 模板利用率的最大化。特别是在处理古 DNA、cfDNA/ctDNA、FFPE DNA、ChIP DNA 以及亚硫酸氢盐转化产物等样本时，单链建库技术具有显著的富集优势，从而提高了古 DNA 研究、基于液体活检的癌症基因组/遗传学等研究的成功率。此外，在 DNA 甲基化检测过程中，亚硫酸氢盐转化 (Bisulfite conversion, BS) 是 DNA 转化的主流技术之一。DNA 单链建库技术可以极大限度地利用和转化 BS 转化处理后的单链和受损 DNA，从而提供完整性更高、偏好性更低的甲基化文库，尤其是在处理低起始投入量样本时具有更明显的优势。

因此，纳昂达新推出定制化 ssDNA 通用型文库制备解决方案，该方案基于高效的单链连接原理，特别适用于低质量样本和微量样本的文库构建，起始量可从 10 pg 到 250 ng，适用于全基因组测序、全基因组甲基化测序，同时兼容液相杂交靶向捕获测序。经过优化设计，该方案可同时兼容 cfDNA、gDNA、FFPE DNA，及其亚硫酸氢盐转化后的产物。